Ce régime met le nombre required d'ions de sodium autour d'un système des charges électriques, par exemple, les atomes d'une macromolécule biologique (protéine, composé d'ADN, de protein/DNA).

Les ions sont mis dans les noeuds d'un réseau cubique, dans lequel l'énergie électrostatique réalise les plus petites valeurs. L'énergie re-computed après emplacement de chaque ion. Une formule simple de Coulombic est employée pour l'énergie :

Énergie (R) = montant (i_atoms, ions) Q_i/ |R-R_i|

Toutes les constantes sont abandonnées à l'extérieur de cette formule, ayant pour résultat quelques d'ensembles d'énergie étranges ; cela n'importe pas afin de la comparaison d'énergie. Pour accélérer le régime, les atomes de la macromolécule sont replacés aux noeuds de réseau, les plus proches de leurs emplacements originels.

On pense que l'erreur donnante droit est moins importante, comparé à cela qui résulte de l'emplacement d'un par un d'ions, ou d'employer le fonctionnement simplifié d'énergie. Les coordonnées des ions mis sont imprimées dans le format d'APB pour davantage d'usage.

On lui recommande que les ions mis soient équilibrés à Monte Carlo séparé ou simulation moléculaire de dynamique. Les modifications insignifiantes au régime devraient permettre l'emplacement de n'importe quelle combinaison des ions polyvalents de différents frais.