Le système d'E-Cellule est un concept de construire les cellules virtuelles sur des ordinateurs.

Le système d'E-Cellule est une suite logiciel orientée objets pour la modélisation, la simulation, et l'analyse des systèmes complexes de large échelle tels que les cellules biologiques, architected par Kouichi Takahashi et sauvée par une équipe merveilleuse des développeurs. Creuser une partie du système, la version 3 d'environnement de simulation d'E-Cellule, permet beaucoup de composantes pilotées par des algorithmes multiples avec différents calendriers pour coexister.

Le projet d'E-Cellule est un projet de recherche international visant développant les supports, les technologies et les plateformes logiciel théoriques nécessaires pour permettre la simulation entière précise de cellules.

Le système d'E-Cellule comprend les trois parties suivantes :

· Expert en logiciel d'environnement (ou d'E-Cellule) de simulation d'E-Cellule
· E-Cellule modélisant l'environnement (ou E-Cellule JE)
· Ensemble d'outils d'analyse d'E-Cellule

Voici quelques fonctionnalités clé « de système de cellules d'E » :

Capacités fondamentales

· Modélisation et simulation orientées objets des systèmes complexes.
· Architecture embrochable. Des classes neuves d'usager-objectif peuvent être développées, dynamiquement chargées, et employées dans la simulation.
· Interaction utilisateur et visualisation en temps réel pendant la simulation.

Script

· Script de python d'une session de simulation (passage/arrêt/manipulation/informatique de paramètre etc…).
· Script de python d'une expérience de simulation qui concerne beaucoup de séries de sessions de simulation (telles que l'analyse ajustante et métabolique de paramètre de contrôle etc…)
· Script de python du rétablissement modèle de dossier (par exemple pour la construction modèle automatisée des bases de données).

Compatibilités

· Niveau 1/2 de SBML important.
· Niveau 1/2 de SBML exportant.

Calcul parallèle

· Partager-mémoire, parallélisation à lecture multiple d'une session unique de simulation. (être fusionné dans la succursale principale.)
· Le boîtier et le réseau ont distribué le calcul des sessions multiples de simulation. Engine de réseau de Sun, (ensemble d'outils de Globus).

Ce qu'il y a de neuf dans ce desserrage :

· Ce desserrage comprend les résolveurs de problèmes améliorés d'ODE/DAE, le soutien de numpy, un préprocesseur empy mis à jour, et encore plus d'améliorations moins importantes.